NPO法人の活動地域には制限がありません。

NPO法人を設立する際に、事務所が同じ都道府県内にあるか、2つ以上の都道府県にあるかによって、所轄庁が都道府県知事または内閣府となりますが、所轄庁が異なるという違いだけとなります。

ですので、活動地域には制限がなく、日本全国・世界中で活動できます。